方法如下：

首先要安装PHP和MySQL环境，为了方便安装，可以直接安装一个WAMP的集成安装环境，可以直接将Apache、MySQL和PHP安装好，将其安装为服务后，禁用Apache的服务，以免其和IIS冲突。

接着是在Windows Server 2003下配置PHP，配置方法是，在IIS的“WEB服务扩展”中，添加一个新的WEB服务扩展，程序后缀为PHP，ISAPI程序为php5isapi.dll，然后再“环境变量”-“系统变量”中增加变量名PHPRC，数值为php.ini的路径，重启服务器即可完成PHP的配置。

接下来安装WordPress MU环境，安装过程和Apache环境下安装一样。

最后，最重要的一步就是设置URL重写（URL rewriter），目前我使用的是一个名为ISAPI_Rewrite 3的ISAPI实现的这个功能，3.0版本ISAPI_Rewrite兼容Apache的mod_rewrite格式，可以直接将.htaccess文件内容复制到httpd.conf中，可惜这个软件的免费版减少了很多有用的功能，多站点设置有点复杂。

ISAPI_Rewrite对于Apache的mod_rewrite并不是完全兼容，还需要对WordPress进行一些修改，打开WordPress MU的wp-settings.php文件，在文件的最开头增加下面这一行：

$_SERVER['REQUEST_URI'] = $_SERVER['HTTP_X_ORIGINAL_URL'];

好了，现在WordPress MU即可在IIS下运行了，WordPress单用户版的配置也是同样道理，而且会更简单。

以上方法来源于福贵的Windows IIS下配置WordPress MU环境。